Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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PtpreP49446 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtpreP49446 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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