Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SrprbP47758 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrprbP47758 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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