Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtgfrP43117 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms