Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Mmp9P41245 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mmp9P41245 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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