Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddit3P35639 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms