Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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