Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NapbP28663 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NapbP28663 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms