Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dusp1P28563 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms