Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RarbP22605 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RarbP22605 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RarbP22605 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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