Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gna11P21278 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms