Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18532 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18532 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
P18532 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms