Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtpraP18052 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms