Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Vpreb2P13373 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms