Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Calb1P12658 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms