Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01788 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01788 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01788 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01788 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms