Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01739 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01739 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01739 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms