Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01734 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01734 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01734 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01734 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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P01734 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01734 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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