Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01643 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01643 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P01643 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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