Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AurkcO88445 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AurkcO88445 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms