Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lnx1O70263 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lnx1O70263 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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