Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ldb2O55203 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ldb2O55203 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ldb2O55203 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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