Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Copb2O55029 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Copb2O55029 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Copb2O55029 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copb2O55029 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copb2O55029 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms