Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CrxO54751 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
CrxO54751 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms