Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sp100O35892 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Sp100O35892 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sp100O35892 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sp100O35892 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Sp100O35892 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sp100O35892 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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