Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cited2O35740 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cited2O35740 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms