Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ptpn9O35239 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ptpn9O35239 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms