Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ArxO35085 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms