Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcshO08795 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms