Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm6871L7N248 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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