Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms