Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc180J3QNE4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms