Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms