Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp17lcG5E8I7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp17lcG5E8I7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms