Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef1G3X9K3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms