Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm20517G3UVU6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm20517G3UVU6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms