Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm28048F7BCN0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm28048F7BCN0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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