Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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