Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptbn5F6UCX4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn5F6UCX4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms