Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Herc1E9PZP8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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