Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms