Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gcn1E9PVA8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gcn1E9PVA8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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