Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms