Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms