Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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BC048679D3YXE9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC048679D3YXE9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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