Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syce3B5KM66 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syce3B5KM66 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms