Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc8B2RUS7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc8B2RUS7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms