Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PtprbB2RU80 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PtprbB2RU80 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms