Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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