Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trabd2bB1ATG9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trabd2bB1ATG9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trabd2bB1ATG9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms