Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spocd1B1ASB6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms